Уважаемые владельцы автомобилей ФПС, сталкивался ли кто-нибудь с такой ситуацией
когда при запуске двигателя с сигнализации, двигатель уже запустился, а стартер еще
примерно секунды две не отключается (продолжает крутить)?

Сигнализация SCHER-KHAN MAGICAR 9.
Минимальное время вращения стартера - 0,6 сек. (минимальное значение)
Максимальное время вращения стартера - 2 сек. (минимальное значение)

Официалы говорят, что такое поведение характерно только для ФПС,
якобы импульс с генератора задерживается.

Не знаю как на SCHER KHAN а на SHERIFF с автозапуском есть выбор оключения стартера по генератору по датчику давления масла и по тахометру . Так надежнее всего по тахометру. Возможно вам подключили как им было удобней.